Compte tenu du poids du poste énergie dans les charges des exploitations agricoles, la Région veut favoriser leur autonomie par leur propre production d'énergie mais aussi, et avant tout, par une maîtrise de leur consommation. Elle consacre 10 % de son budget agriculture aux thématiques énergétiques (soit plus de 2 M').
Elle est partenaire du programme Eco énergie lait destiné à réduire les dépenses énergétiques liées aux matériels de traite dans les exploitations laitières.